1940年,柏林市2万名犹太人被关押进强制劳动营。1940年底,德国已有27万名犹太人,被迫逃离德国。以后,各级纳粹官员又绞尽脑汁地试图把犹太人赶到巴勒斯坦和马达加斯加;1940年7月,纳粹当局根据阿道夫&iddot;艾希曼之流的提议,把他们驱逐到波兰东部卢布林地区一块面积大致为100平方公里的荒凉沼泽地带‐‐尼斯科建立&ldo;民族家园&rdo;,让严酷的环境把犹太人自然淘。1939‐1940年冬天,纳粹当局从奥地利和波希米亚一摩拉维亚向尼斯科遣送去第一批犹太人;从1940年2月开始,又开始从德国向尼斯科遣送犹太人;同年秋天,法国败亡后,纳粹又开始从阿尔萨斯一洛林、萨尔和巴登地区向法国南部集中犹太人,再把他们遣送尼斯科。
第三阶段:特别行动队‐‐犹太人被大批押送刑场(193811‐‐1942)
还在1938年11月的&ldo;水晶之夜&rdo;,戈贝尔等纳粹党魁就曾指示其党员和其他暴徒杀害犹太人,一夜之间即有91个犹太人死于非命,42人重伤。从纳粹德国占领波兰的1939年9月到同年年底,又有25万波兰犹太人被杀害。不过,这种屠杀不是按照最高当局的统一指令进行的,而是一些党卫军、保安警察地区头目根据自己的意愿自行其事的结果;而且,相当一部分谋杀还是仇视犹太人的波兰人所为。那时,纳粹领导集团对如何处置犹太人,尚未达成共识;因此,杀害犹太人还不是普遍的政府行为。1939年9月,纳粹德国侵占波兰后,党卫军甚至陆军官兵对犹太人的烧杀抢掠时有发生,但还不是有计划的步伐统一的大屠杀。1941年纳粹上层对全部杀死苏联的犹太人‐‐亦即他们最为仇视的犹太一布尔什维克取得一致意见,而对西欧的犹太人,纳粹的政策还只是逐步限制其行动,把他们赶人犹太隔离区。从1939年9月1日到1941年6月22日纳粹德国入侵苏联之前,在纳粹统治地区被杀害的犹太人只有30万多人。
入侵苏联是纳粹分子开始大规模屠杀犹太人的,苏联。东欧各国的犹太人,从此面临灭顶之灾。而作为种族灭绝犯罪组织的特别行动队,也开始登台亮相。1941年5月,中央保安总局局长海德里希召集保安警察、秘密警察。刑事警察首领开会,决定成立a、b、c、d四支特别行动队,跟在入侵苏联的陆军部队之后,专事杀害当地的犹太人以及共产党骨于分子。a支队:先由党卫军少将施塔勒克指挥,他被抵抗运动处决后归党卫军少将海因茨指挥;其任务是穿越波罗地海沿岸三国,向列宁格勒方向行动。其总部设在加特斯奇纳,在卢萨和雷瓦各设一个特遣队,在里加和考纳斯各设一支突击队。b支队:首任队长是党卫军少将阿图尔&iddot;奈比,继任是党卫军少将埃利希&iddot;瑙曼。其任务是向莫斯科方向行动。其总部设在斯莫棱斯克,在维亚兹马和莫吉廖夫各有一个突击队驻防,在图拉和里埃沃各有一个特遣队驻防。c支队:先由党卫军少将奥托&iddot;拉施指挥,继而由党卫军少将托马斯指挥。其活动范围是除去南部之外的乌克兰大部分地区。其总部设在基辅,在基辅、哈尔科夫、波尔塔瓦、斯大林诺各设一个突击队。其中,党卫军少校波罗尔率领7个特别行动分队,驻扎在基辅四周,每个分队有千人左右,还吸收了一批当地的乌克兰惯犯和流氓。1941年9月底巴比雅尔大屠杀,就是波罗尔及其下属犯下的滔天罪行。d支队:首任指挥是党卫军上校奥托&iddot;奥仑道夫,继任是党卫军准将布莱察普。其任务是在乌克兰南部、克里米亚半岛和高加索一带行动。其总部设在辛菲罗波尔,在塔甘罗格一罗斯托夫、雅尔塔、斯卡多沃斯克、敖德萨。斯大林格勒各设一个突击队。这四个支队全部建于1940年冬末,直属海得里希领导;队部分别设在易北河畔的普雷奇边防警察学校、穆尔德河畔的小城迪本和巴德施密德贝格的边防警官学校。各个特别行动队的兵力相当于一个营。以a支队为例,其组成人员为:秘密警察占9%,保安警察占3.5%,刑事警察占4.1%,治安警察占13.4%,外国辅助警察占8.8%,武装党卫军占34%;其余为技术和文职人员。一个特别行动队的总人数,多则990人,(如a支队),少则500人(d队)。各个特别行动队均为摩托化装备。每个队一般分为两三个分遣队或者规模更小的特遣队,各为70‐120人,分别配合指定的军团作战。基层单位是小队,每个小队约20‐30人。
1941年5月,中央保安总局的头子海德里希和他的人事处长布鲁诺&iddot;斯特雷肯巴赫先后在普雷奇和迪本召开多次极端秘密的会议,向特别行动队的队长。分队长和特遣队长传达了著名的&ldo;元首命令&rdo;:&ldo;为保证被征服国家的政治安全,在德军占领地区及其后方作战的各特种部队要无情地镇压针对民族社会主义的一切反抗,不管这种反抗是以前、现在,还是将来发生的。&rdo;于是,在苏联欧洲部分的每一个地区,犹太人、共产党员以及游击队员,都成了纳粹的首要消除目标;稍后需要消灭的目标是吉普赛人和居住在克里米亚、讲土耳其语的克兰特查泰斯人(纳粹的种族专家并没有证实他们具有犹太血统,仅仅是个别党卫军将领如此认为)。同苏联开战不过一周,立陶宛首都维尔纽斯的犹太居民就成为苏联境内第一批牺牲者。仅仅20多天,足有上万名犹太人被纳粹指使的当地歹徒打得脑浆迸裂,横尸街头。1941年7月1日,纳粹德国军队占领了苏联拉托维亚首都里加。8月1日,党卫军保安勤务处和保安警察的第一个特遣支队进入里加,随后便开始清除计划,力求使奥斯特兰(即对被占领的波罗地海三国的重新命名)的犹太人绝迹。纳粹当局决定把里加作为将德国和奥地利犹太人驱逐到集中营和灭绝营的中转站。1941年8月互日至1944年10月14日之间,近20万纯粹的德国犹太人和奥地利犹太人被运到里加,其中8万人留在当地,全部被杀害z余下的12万人继续运往波兰南部的6个灭绝营(包括奥斯维辛和马伊达奈克);只有400多人活着出来,其中的一半又死于施图特霍夫集中营或死在去马格德堡的&ldo;死亡行军&rdo;途中。