六月一日,日军前卫司令官川村景明率近卫步兵第二联队(缺第四、第八中队),宿营于三貂岭之巅。二日拂晓,日军自三貂岭宿营地出发,向瑞芳前进。上午七时五十分,日军便向瑞芳发起了进攻。
先是六月一日拂晓,广东守备刘燕率炮勇三十人运格林炮五门至,俞明震急命运至前敌。刘燕以瑞芳西面高地为阵地,列炮扼守。俞明震亦率亲兵六十人赴前敌督战,拟凭刘燕炮队以固守。二日晨,张兆连决定进战,吹角列队。即在此时,日军大队已开始进攻。双方遂展开了激战。清兵或&ldo;隐于村落的土墙后&rdo;,或&ldo;潜于茂密树林之间,巧妙地利用地物猛烈射击&rdo;。注5据日方记载:&ldo;敌人的抵抗意外顽强,或仅仅以数十名前来逆袭,或单独潜伏房屋竹丛中,待我通过后加以狙击……我方死伤较多。&rdo;注6在激战中,提督张兆连重伤,记名提督陈得胜战死,余众不支。日军遂两路包围清军炮兵阵地,刘燕督兵抗御,死伤甚众。俞明震率亲兵助战,亦被弹片击伤,被部下抬至狮球岭。瑞芳遂陷。在此战中,日军死伤十九名。第二联队长阱并重季大佐被枪弹洞穿军服,侥幸地保存了性命。清军则有三十余名战死,三十余名被俘。注7
六月三日晨六时,日本近卫师团又由瑞芳宿营地出发,向基隆进犯。进攻前,北白川能久将部队分为三部:以步兵第一联队第二大队及工兵一小队为前卫,沿大道向基隆前进;步兵第二联队第二大队(缺两个中队)为右翼,继前卫之后,向八斗方向前进,护卫师团之右侧;步兵第二联队第七中队为左翼,在瑞芳附近通向暖暖街的道路上扼守,护卫师团之左侧。上午十时半,日军前卫与清军二百余名遭遇,清军略事抵抗后退走。不久,日舰从海上开始向基隆炮击。正中午时,在猛烈炮火的掩护下,川村景明指挥八个中队向基隆市街发起猛攻。至下午一时许,忽然阴云密布,大两倾盆,云雾之中咫尺难辨,日兵浑身淋透,行进困难。双方相持五个小时。直至下午五时,日军始突入市街。于是,清军便与敌人展开了巷战。他们有的持刀剑击杀敌人,有的从民房窗内向敌狙击,直到最后战死。日军在进攻基隆的战斗中,伤亡三十一人。注8
在进攻基隆的同时,日军又向狮球岭发动了攻击。狮球岭在基隆市街西北,扼基隆去台北通路,故岭防实为省会之关键;八堵适在其后,当狮球岭之冲。日军欲攻台北,此为必由之路。本来,狮球岭由道员林朝栋率栋字十营驻守。林为抗法名将,曾随刘铭传据此抗法,战功卓著,&ldo;所部将土皆前随征之人,地势险要甚悉&rdo;注9,&ldo;且训练有法,颇负时望&rdo;。他因与张兆连不和,被唐景崧调往台中。时台北绅土十余人皆建议调林回,&ldo;以守为战,事犹可为&rdo;。唐景崧虽电令林朝栋回援,然远水不救近火,只得于是日中午先派中军副将黄翼德率护卫营往扎八堵。黄翼德为人狡诈,至八堵即回,诡言:&ldo;狮球岭已失,大雨不能扎营,且敌悬六十万金购总统(唐景崧)头,故趋火车急驰回城,防内乱。&rdo;注10唐景崧知其欺罔,而不敢诘问。于是,防守狮球岭的兵力仅知县胡友胜的粤勇四营,实际上已经成为孤军。尽管如此,胡友胜仍督军苦战,坚守不退。一个日本随军记者写道:&ldo;我军虽集中射击,而守军却巍然不动。风雨愈急,日近黄昏,枪炮声与风雨声相合,相当凄厉可怕,真不知何时才能攻占!我军再合力攻击,而炮垒后面仅有险峻之栈道相通,前面亦仅可攀,难以发起冲锋。在炮垒与市街之间,是水田与竹丛,且相距甚远,我军架设在炮垒下面的一门山炮亦不能奏效。&rdo;注11日军占领基隆市街后,四面包围了狮球岭。战至下午六时,狮球岭终被日军攻陷。
狮球岭既失,省城外围险要尽失,台北危在旦夕。但日军一时尚不明台北情况。又由于日军占领基隆后,有两名清军士兵将火药库点燃爆炸,炸死日军军官一人、士兵二十人,炸伤军曹一人、士兵二十余人及夫役等一百余人,其中重伤十七人。注12同时,港内的水雷尚待扫除。所以,日军未敢冒然立即西犯。六月四日,比志岛义辉率混成支队主力分乘丰桥丸和佐仓丸,由澎湖抵基隆,以增援近卫师团。日本政府所派台湾民政局长水野遵也来到基隆,以便着手筹组殖民机构。
是日黎明,雨稍歇,台北市街寂然,异常平静。俞明震等见唐景崧,力劝其退守新竹,与林朝栋、刘永福二军联合,以图再举。唐景崧不应。俞明震知事已不可为,退后书密函呈唐曰:&ldo;天不佑中国,无可奈何,公心迹可告无罪。惟计不退守新竹,公宜自为计,不可贻笑天下。&rdo;注13实劝唐离台勿落敌手也。是夜,前敌溃兵入城,台北大乱。未几,巡抚衙门院内火起,唐景崧由抚署后门出,匿于德国洋行。既而微行至沪尾,两天后乘德船鸭打号内渡厦门。
六月六日,台北艋甲绅士李秉钧、吴联元、陈舜臣等议迎日军,往商大稻埕李春生,共拟请日军进兵台北的公呈,然无人敢前去递送。有杂货商人辜显荣注14自告奋勇赴基隆,由水野遵接见。日方因不明台北情况,对此将信将疑。随后,台北基隆间电话线修通,日军突接台北电信局洋员汉森来电:&ldo;台北非常混乱……台北之道路已向贵军队全部开放,未留一兵一卒。在本府之文武官亦皆已逃走。&rdo;又电称:&ldo;深盼总督阁下迅急来此。&rdo;注15方知辜显荣所报是实。恰在此时,美国《纽约先驱报》记者达菲德逊、英商汤姆逊及德商奥利亦来日营,自称代表台北外侨请日军从速开赴台北。